كسي كه كتاب دكتر قفاري را مطالعه مي‌كند نمي‌تواند به اين نكته پي برد كه نويسنده از چه اسلوب و روشي در تحقيق پيروي كرده است؛ از اين‌رو بر خود لازم دانستيم تا نظري منصفانه در جهت ارزش‌گذاري بر روش تحقيق او داشته تا مشخص گردد نحوه ارائه دلايل، شواهد و نتيجه‌گيري وي از آنها به چه كيفيتي بوده است؛ چرا كه آشنايي با روش تحقيق، استدلال و اطلاع از نقاط ضعف و قوت در اين زمينه است كه خواننده را از بسياري از زواياي بحث كه در ابتدا مشكل و پيچيده به نظر مي‌رسد آگاه مي‌سازد؛ چنان‌كه ناتواني در پاسخ گويي به شبهه از عدم شناخت همين نقطه ايجاد مي‌گردد. اضافه بر اين كه آگاهي از عوامل دروني و ريشه‌اي كه پيرامون بحث را احاطه مي‌كند و نيز آشنايي با زمينه‌‌هاي فكري و فرهنگي كه باعث ورود محقق و يا نويسنده به موضوع بحث گرديده سهم به سزايي در آشكار شدن معلومات و پايه‌هاي علمي محقق و سنجش نتايج به دست آمده از بحث دارد.

با توجه به شاخصه‌هاي علمي و آكادمي به كار گرفته شده در نقد اسلوب و روش به كار گرفته شده در تحقيق اين كتاب و شناخت عوامل داخلي و خارجي تأثير‌گذار بر آن، ما نيز بر آن شديم تا مختصراً، به بررسي برخي از خلل‌ها و نواقص اساسي موجود در روش و اسلوب دكتر قفاري كه در كتاب «اصول مذهب الشيعه» به كار گرفته شده بپردازيم؛ اما قبل از ورود به بحث، لازم است تا برخي از موارد اختلاف اين كتاب با ساير كتاب‌هايي كه در صدد ايراد اشكال و شبهه به شيعه بوده‌اند را بيان ساخته و انگيزه‌هايي كه باعث گرديده تا مؤلف به نوشتن اين كتاب روي آورد را آشكار ساخته و سپس اسلوب و روشي را كه نويسنده ادعاي پاي‌بندي به آن را نموده مورد نقد قرار داده و با شواهد واضح و آشكاري ثابت نماييم كه نه تنها اين موارد را رعايت نموده بلكه كاملاً بر خلاف آنها عمل نموده است.